2016年深圳北理莫斯科大學建校伊始即成立馬克思主義理論教研室，隸屬學工部，承擔全校本科生思想政治理論課（簡稱思政課）教學任務。2022年4月22日成立直屬學校的馬克思主義理論教研部，并開始籌建馬克思主義學院。2022年12月29日馬克思主義學院正式建立，統一承擔全校思政課的教學與改革工作、思政課教師的管理工作和當代中國馬克思主義的傳播與研究工作。
學院在校黨委書記直接領導下，以全面推進習近平新時代中國特色社會主義思想進教材進課堂進頭腦為目標，以建設好立德樹人的根本課程為中心任務，重在引導學生系統掌握馬克思主義基本原理和馬克思主義中國化理論成果，了解黨史、新中國史、改革開放史、社會主義發展史，認識世情、國情、黨情，深刻領會習近平新時代中國特色社會主義思想，培養運用馬克思主義立場觀點方法分析和解決問題的能力。結合我校辦學特點和培養目標要求，著力構建“大思政課”育人格局，努力培養支撐服務“一帶一路”建設、促進中俄新時代全面戰略協作伙伴關系、擔當民族復興大任的時代新人。
學院下設“習近平新時代中國特色社會主義思想教研中心”“馬克思主義基本原理教研室”“馬克思主義中國化教研室”“思想道德與法治教研室”“中國近現代史教研室”“形勢與政策教研室”和籌建中的“深港融合發展研究所”“國際政治研究所”。現有專任教師9人，行政人員1人。教師中教授 5人，高級講師1人，講師2人，博士后1人。
學院聚焦中俄（中蘇）百年留學史、中共六大與莫斯科等紅色資源打造特色實踐教學品牌，積極推進大中小一體化實踐教學基地建設，探索“大思政課”視野下思政課協同育人機制的實現路徑，致力于中外合作辦學高校思政課建設和教育教學改革創新的突破。在科學研究方面，依托地域優勢和研究隊伍的前期基礎，形成“深圳改革開放口述史研究”“港澳青年政治認同研究”等重點研究方向和學術生長點，力爭以一系列高水平研究成果支撐粵港澳大灣區和深圳社會主義先行示范區建設。
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